目前国内外疫情仍以JN.1为主流病毒株，考量KP.2及KP.3变异株为JN.1衍生後代，且两者与JN.1之间棘蛋白突变位点差异小，经卫生福利部传染病防治谘询会预防接种组（ACIP）讨论，建议以单价JN.1疫苗因应我国今年秋冬面临COVID-19之疫情，尽早提供民众接种提升免疫保护力，防范新冠侵袭。自今年十月一日起单价JN.1疫苗将与流感疫苗同步分两阶段开打。

ACIP召集人李秉颖表示，新冠病毒变异株演化情形，KP.2、KP.3亚变异株，皆是由JN.1变异株衍生发展而来。目前流行之JN.1、KP.2、KP.3变异株之间突变位点差异小。相较XBB.1.5疫苗，於追加接种含单价JN.1疫苗後能有效增强对JN.1变异株的中和作用，对於KP.2、KP.3亚变异株也具有较高交叉中和作用。

根据WHO会议，以现有科学证据而言，若计算抗原距离，无论选定JN.1、KP.2等疫苗应都能提供交叉保护，推论选定JN.1之决定应仍具科学意义。WHO推动JN.1作为新版疫苗抗建议，目前尚不会因为美国改为KP.2而改变。建议各国政府与专业机构，不应为了持续变异的病毒株而产生延迟，而是在有疫苗的时候若高风险族群或特定对象有需要即应建议其施打，因病毒不断变异，不可能永远等新疫苗生产；以高风险群而言，早接种比起延後接种（或无接种）其利应大於弊。

疾管署表示，参酌WHO与多数国家建议及莫德纳JN.1疫苗动物试验报告，以及国内外疫情以JN.1为主流病毒株，建议以单价JN.1疫苗作为我国今年秋冬接种之新冠疫苗，并於十月与流感疫苗同时开打，尽速提供民众可对抗主流病毒株之免疫保护力。另，欧盟与邻近日本、韩国亦同时采用单价JN.1疫苗。

疾管署长庄人祥指出，今年JN.1疫苗预计向莫德纳采购五五○万剂，Novavax则规划采购五○万剂左右；目前了解，Novavax的厂商预估八月才会送件到食药署做药证审核（EUA可能都过期），保守估计，希望在今年年底可以打得到。

由於今年秋冬供应之莫德纳疫苗十二岁以上为单剂型（○·五mL／剂），十二岁以下为多剂型（○·二五mL／剂／每瓶十剂），相关接种期程及建议如下∶一、接种时程与对象∶第一阶段（今年十月一日起）∶同流感疫苗第一阶段实施对象。第二阶段（今年十一月一日起）∶满六个月以上民众（未列在第一阶段实施对象）；而流感疫苗则提供给五十至六十四岁无高风险慢性病成人。

接种建议∶满六个月至四岁幼儿∶1.未曾接种COVID-19疫苗者接种二剂，二剂间隔四周（二十八天）以上；2.曾接种COVID-19疫苗者接种一剂，与前一剂间隔十二周（八十四天）以上。满五岁以上儿童、青少年及成人∶接种一剂，曾接种COVID-19疫苗者与前1剂间隔十二周（八十四天）以上。