有關媒體報導指出，有第一線醫師群組傳出「口服和針劑型流感抗病毒藥物出現抗藥性比例升高造成療效下降情形」一事，疾病管制署表示，根據疾管署監測資料顯示，今年流感季累計檢驗A型H1N1病毒株約六‧五%對口服抗病毒藥物克流感或易剋冒成分（oseltamivir）及注射抗病毒藥物瑞貝塔（Peramivir）具抗藥性相關突變，略高於去年（去年底統計為三．二%），A型H3N2和B型流感病毒株今年則均未驗出上述藥物抗藥性；另無論A型H1N1、A型H3N2或B型流感，針對口服型自費用藥紓伏效錠（Baloxavir）抗病毒藥物今年均未驗出抗藥性相關突變。

疾管署評估，前述抗藥性比率仍低且限於A型H1N1，此外，國內於九月進入流感流行期後，社區流行的流感病毒近期已轉為未檢出抗藥性的A型H3N2病毒株占多數（近四週占五十一‧三%，高於A型H1N1之四十三‧四%），A型H1N1占比持續下降。

自今年十月一日起公費流感抗病毒藥劑除原來全年適用之高風險族群外，將擴大至特定高傳播族群，凡出現類流感症狀，經醫師評估後，無需快篩即可使用，且公費流感疫苗也將於同日開打，流行病毒亦已轉為A型H3N2為主，前述部分A型H1N1病毒株抗藥性，整體對臨床治療及疫情控制影響有限，該署也將持續密切監測病毒株流行及抗藥性情形，滾動調整相關防治策略。

疾管署再次提醒，民眾勿輕忽流感嚴重性，務必做好呼吸道衛生與咳嗽禮節，落實勤洗手、有發燒、咳嗽等類流感症狀，宜戴口罩及早就醫、生病在家休息等措施。

有關公費藥劑使用條件、合約醫療機構名單及流感防治資訊，可至疾管署全球資訊網（https://www.cdc.gov.tw），或撥打免付費防疫專線1922（或0800-001922）洽詢。