關於有媒體報導指稱經濟部水利署第六河川分署刻意打開淤塞，使廢水排入曾文溪一事，第六河川分署今（十三）日表示，近期為因應巴威颱風及汛期防洪需求，辦理排水路清疏及水門維護等作業，降低颱風期間路上積水、淹水風險，自七月六日早上八時起便保持水門開啟至今日，主要目的在維持排水路暢通，均屬必要且例行性的防汛措施，無其他考量。

第六河川分署指出，各項防洪閘門操作均依水門標準作業程序（SOP）辦理，巴威颱風威力強大，該分署自然以防洪安全及排水需求為唯一考量，無針對特定水體進行特殊處置之可能。水門平常也多保持開啟，保持水路暢通，若預防外水太高、海水倒灌，才會關閉水門。所謂「被水沖走」應是因為降雨導致的自然現象，與該分署無涉。

至於有媒體報導提及排水顏色異常、水生生物死亡及水質快篩結果等情形，第六河川分署表示，相關水質監測、污染源查處及責任釐清，依法均屬環保主管機關權責，該分署尊重且全力配合調查。

水利署強調，河川及排水設施管理的首要任務，在於維護排洪功能及保障民眾生命財產安全。對於外界關注的排水及環境議題，後續仍應由權責機關依法調查，釐清來源並研擬改善措施；第六河川分署也將持續配合相關機關，共同維護河川環境及公共安全。