有關媒體報導，澎湖漁船在臺南安平載運三百箱皮刀魚返回澎湖七美，遭海巡署及漁業署人員刁難一事，漁業署特別說明。

漁業署指出，漁船設計係做為漁業作業使用，基於航行安全原因，除特殊情形外，不得做為貨船使用。本案漁船載運三千公斤皮刀魚，已超出一般漁船單一航次作業所需魚餌數量。

鑑於近期少數漁船以魚餌名義，載運大量水產品出港，實則前往大陸港口或以海上交易方式，將船上水產品送進大陸地區行為，海巡機關掌理入出港船舶或其他運輸工具之安全檢查事項，該船因載運大量魚貨，又漁船主說明係供作業使用；爰海巡署與漁業署啟動查察機制，經勸導漁船主勿違反規定後，該批魚貨載運至七美冷凍，本案尚未認定漁船違規。為妥善解決類似案件，漁業署將邀集交通部及澎湖縣政府研商，亦會聽取漁民意見。