前臺灣高等法院臺中分院法官兼庭長袁從楨律師表示，太極門案有兩個很大的荒謬點，一是稅捐機關根據起訴書課稅，最高法院已判決無罪、無稅，稅捐機關竟繼續課稅；二是81年度綜所稅的判決，在事理上是荒唐的。所有年度性質都一樣，其他年度都撤銷，卻只有81年度稅單成立。若是判決有違法，依大法官會議釋字第135號解釋，重大違法的判決是無效的，後續的處分與執行也都無效！

前高雄國稅局簡任稽核黃坤光強調，太極門案是用稅務機關虛擬的所得去課真實的所得稅，這就是非法課稅、栽贓枉法，已經牴觸他個人的紅線，身為稅務人員他引以為恥。呼籲每一個執行公權力的人，不要當禿鷹，禿鷹是死亡和邪惡的代表，也希望所有被同樣迫害的人可以根據他所提供的法條敘述申請國家賠償。

國立中正大學財經法律學系兼任教授、前最高行政法院法官林文舟表示，回顧古代或戒嚴時期，因為信仰、思想或言論問題被定罪的，血跡斑斑，例如清朝的文字獄。而在後威權時代，當公權力侵犯言論與思想自由，會先將人扣上道德的罪名，例如太極門案中，以查稅、養小鬼等名稱來迫害太極門師徒，或用所謂散佈假消息以社會秩序維護法、或行政法或刑法或稅法來查水表等，對人民進行壓迫，實質就是政府不喜歡你的思想與言論，就利用職權進行迫害之實。