歐洲宗教間宗教自由論壇主席Eric Roux認為，台灣在轉型正義做了非常多，但非常訝異政府竟將轉型正義劃地設限「法律追溯年限」為1945年到1992年，這會讓侵害人權的事實被排除在外，就像讓地雷一直留在戰場上。如1992年後，台灣仍發生太極門案等人權迫害事件。他呼籲政府應解決太極門案，恢復其名譽、賠償並彌補過錯。「人們必須正視邪惡，就算邪惡不再發生，人們可能會忘記，但仍須要保持警惕，了解怎樣才能讓悲劇不再發生。」

《寒冬》雜誌總編輯Massimo Introvigne教授認為，台灣後威權時期1996年太極門人權迫害案件，人們有權要求轉型正義，特別是在從獨裁政權過渡到非獨裁政權之後，「我們都熱愛正義，太極門當然應該得到正義。」

大學助理教授魏賜聰表示，台灣解嚴至今已經過36年，但威權餘毒仍存，國家暴力繼續殘害國家人民。魏賜聰以數次被監委調查的侯寬仁為例：在周人蔘案中，纏訟24年涉及約200名被告，包括3名檢察官、38名官警，最後官警被判有罪的僅有8位，因為侯寬仁不斷釋出聳動消息鼓動風潮，導致調查期間就有4名警官不堪其辱，2位舉槍自盡，2位投河自殺。

2002年雲林廢土案，監委查出侯寬仁有三點違失：曲解當事人本意、自問自答出言恐嚇、擅改口供，偽造筆錄。2006年台北市長馬英九特別費案及2007年副總統呂秀蓮的國務機要費案，分別涉及偽造文書與涉不實筆錄；甚至當時檢察官侯寬仁並未傳喚呂副總統就直接起訴國務機要費案，最後獲判無罪。1996年太極門案，偵辦過程侯寬仁不斷違反偵查不公開，大量洩漏不實辦案內容給媒體，製造輿論未審先判的假象，詐欺、逃漏稅，甚至荒謬的「養小鬼」不斷抹黑。侯寬仁沒有被懲處還繼續升官，是最壞的示範。

魏賜聰指出，日本大阪特搜部主任檢察官前田恒彥在2009年偵辦厚生勞動省一起偽造文書案件，竄改湮滅證物誣陷一名厚勞省官員，後來被媒體踢爆。2010年他與涉嫌包庇的大阪特搜部正副部長相繼被捕定罪，其直屬上司等6人都處以減薪、申誡等懲處，上任不到半年的總檢察長也因此引咎下台。「兩宗同樣是違法筆錄之檢察官，相較於日本的嚴重懲罰，台灣反而以『升職』然後再『口頭警告』或『申誡』。」