实践大学企管系副教授蔡政安表示，转型到民主的过程不是一蹴可几。在1988年到2016年後威权统治时期，行政权独大，整肃异己的风气非常盛行。1996年发生了太极门案，当时威权政府动员了许多的媒体、司法机关，用媒体抹黑、刑事诈欺起诉，还有行政课税三部曲，导致迫害太极门信仰自由的人权案件。监察院2005年就将此案列为重大人权保障案件，等於是政府公开认证的人权重大案件。然而对於前政府不正义的迫害人权事件，现任政府处理机制却限缩在一定的范围及时间内，而且都只注重於补偿，没有处理名誉恢复及真相追查。政府在2016年通过不当财产条例、2017年通过促进转型正义法案，都将时间限於国民党执政时代的1945年到1992年期间的侵犯人权迫害案件，排除了1992年之後，事实上将许多国家公权力迫害人民案件都被排除掉，这是典型限缩式、自我阉割式的转型正义。

蔡政安指出，1980年代全世界有一百多个国家陆续从威权独裁转型成民主政体，同样面临很多处置威权遗毒的问题，转型正义是提供平反历史不正义的解决机制，必须包括追查真凶、不能再犯，必须要补偿、要平反，没有时间的限制等等，成为民主法治国家治理原则的新典范。台湾离这样新典范是远远不足，令人遗憾，不是只有太极门的人权迫害案件，只要是1992年之後受到政府公权力迫害的人权案件，都没有被纳入，是目前台湾转型正义很大的缺点。
法税改革联盟发起人陈逸南谈到，太极门案从法律层面来讲，最高法院判决太极门没有违反税捐稽徵法，就没有税的问题，那麽税单就应该收回去，可是国税局坚持就不收回去。国外人权宗教学者专家来台湾拜访政府官员，这时候自己就应该要谦虚地承认税单开错了，现在依照行政程序法117条就可以解决。到现在还没有人有勇气站出来！他直言∶这很简单就能平反，可是弄了这麽多年，浪费很多人力资源、司法资源、政府资源，实在很不值得。

太极门案受到国际瞩目，成为检验台湾转型正义是否成功的试金石，也是台湾是否落实人权保障的指标。回顾2022年7月13日多位国际知名宗教学者和人权专家签署了一封致台湾最高当局的公开信，呼吁解决太极门案。「太极门从未违法，也没有逃税。」因此，没有理由不把修行圣地归还给太极门。至今年四月国际组织已七度将太极门案提交联合国人权理事会，CAP-LC提醒人权理事会，太极门案「说明了以税收和没收财产的手段，作为歧视及迫害宗教与心灵少数团体的可怕後果。这不符合宗教或信仰自由的国际原则。」CAP-LC要求所有相关当局停止这些形式的歧视行为。