台灣人權文化協會理事長吳進生表示，知名義大利社會宗教學者馬西莫教授（Massimo Introvigne）曾在《寒冬》雜誌指出，台灣監察院、法務部和高檢署之間的互相推託削弱了監察院的功能，放任違法檢察官不管，就像毒素蔓延汙染水源，本應保護人權的監察機構變得虛假，如果法務部在91年監察院報告完成後立即追究侯寬仁檢察官的責任，其後衍生的太極門稅案早就不成立，還能讓惡官群魔亂舞嗎？

台北律師公會人權委員會委員黃帝穎律師表示，太極門氣功養生學會從民國55年成立至今都是氣功武術門派，行政機關把81年度的敬師禮當作補習班學費要課稅，未能與其它年度做一致性處理，不符行政自我拘束原則，違反憲法平等原則。行政程序法第117條就有特別規定，行政機關有職權可撤銷違法處分，沒有救濟期間的問題，行政機關知道過去做錯了，應該自己撤銷違法處分。

輔仁大學法律學系教授暨法律學院院長吳志光表示，行政應該要積極為人民解決問題，但在太極門稅案中，最令人憤慨的也是行政機關的不作為，例如唯獨對單一年度課稅，讓他覺得匪夷所思，當初行政院也做了協調，稅捐機關卻不遵行。太極門稅案這麼簡單的事遲遲無法解決，難怪人民對司法的滿意度一直無法提升。

前新北市記帳士公會理事長蔡維杰則指出，所有的課稅事實都應秉持一致性的原則，太極門稅案80-85年有5個年度更正為零，只留下81年度，為何沒有辦法認錯？從5個年度更正為零沒有撤案這個動作，就知道稅捐單位不認錯，更正為零並沒有把稅單整個撤案，只說是計算錯誤，這叫死不認錯。政府是一體的，前朝的錯沒辦法予以糾正，給予更正，還叫英明的政府嗎？

太極門案義務辯護律師蔡富强表示，太極門81年度稅務冤案屬枉法裁判，且陸續有新事實、新證據證實課稅處分及該確定判決均屬錯誤，國稅局有義務依稅捐稽徵法第40條規定，聲請停止執行並撤回執行，然而國稅局明知原課稅處分錯誤違法，還要求行政執行署繼續執行、查封拍賣太極門的修行道場預定地並強行收歸國有，有故意侵害財產權之主觀惡意，符合國家賠償法第2條第2項規定，應予以國家賠償，並呼籲監察院列案調查，予以平反，以彰顯監察院保障人權之功能。