有關臺北市「寶林茶室」食品中毒事件，食藥署副署長林金富表示，當日絕無表示不願意協助處理檢體，協調後仍由食藥署攜回三十五件食材予以檢驗，並配合衛福部三月二十七日專家會議，食藥署與疾管署、臺大法醫研究所、臺大醫院、臺北榮民總醫院分工對食材、病人檢體及環境檢體辦理後續檢驗。

初因事件緊急，有速為介入協助臺北市政府之必要，食藥署主動於三月二十六日前往稽查，邀請毒物專家及疾管署防疫醫師隨行，也會同臺北市政府衛生局一同行動，希望查出事件原因。臺北市政府命寶林餐廳停業，新北市政府查核粿條的供應商並令其暫時停止營業，中央地方共同合作查找原因並預防事態擴大，衛生單位同仁查核至深夜，本署並未就臺北市政府衛生局對寶林茶室停業一事，做任何相關批評，食藥署主動攜回食材檢驗，並嚴正聲明從未關切寶林停業事件。