前台湾高等法院台中分院法官兼庭长袁从桢律师认为，改革最重要是每一个法官的心灵品质，强调良知的判断。当政者要正心诚意，不能有私心。一般公务员为了考绩都会走火入魔，更何况像税务人员还有税务奖励金，为了奖金不怕冤枉人，这是最让他痛心的。在他的司法生涯里，从未接过刑法第125条滥权起诉、违法取供的案件，以及刑法第129条(违法徵收)，税务人员不该徵收而徵收。以太极门案而言，税单用间接推计的做法，并没有经过财政部的核可，违反所得税法第83条之1。税务单位违法，所以(民国)81年度判决是违法，就不能执行，政府强制执行拍卖太极门修行道场预定地是不当得利，是可以被质疑的。

前法官暨真理大学财经学院法律学系副教授林灿都表示，法治国家应该依法行政、司法、立法，但我们真的是法治国家吗？课税一定要回到平等原则，相同的事情要做相同的处理，不同的事情才做不同的处理，这就是平等。太极门案明显没有受到平等的对待，从民国55年成立迄今本质没有变，却只有一年要被课税。因为一个检察官的滥权，案件到现在没有办法解决，显然是制度出了问题。

前台湾基隆地方法院庭长陈志祥律师认为，太极门案刑事跟税务案件，其实都是侵害信仰自由的案件，(民国)81年度的综所税案件依行政程序法第117条就可以直接撤销，撤销之後，原则上会认为之後的所有程序就失所附丽，都失效了，整个连根拔起解决。有关再审，刑事诉讼法再审几乎都没有时间限制，可是行政诉讼跟民事诉讼就有，5年而已。所以，如果认为81年度的判决是错误的，5年後就没有办法提再审。国家的错误不应该有时效限制，民事、刑事跟行政都一样。