前臺灣高等法院臺中分院法官兼庭長袁從楨律師認為，改革最重要是每一個法官的心靈品質，強調良知的判斷。當政者要正心誠意，不能有私心。一般公務員為了考績都會走火入魔，更何況像稅務人員還有稅務獎勵金，為了獎金不怕冤枉人，這是最讓他痛心的。在他的司法生涯裡，從未接過刑法第125條濫權起訴、違法取供的案件，以及刑法第129條(違法徵收)，稅務人員不該徵收而徵收。以太極門案而言，稅單用間接推計的做法，並沒有經過財政部的核可，違反所得稅法第83條之1。稅務單位違法，所以(民國)81年度判決是違法，就不能執行，政府強制執行拍賣太極門修行道場預定地是不當得利，是可以被質疑的。

前法官暨真理大學財經學院法律學系副教授林燦都表示，法治國家應該依法行政、司法、立法，但我們真的是法治國家嗎？課稅一定要回到平等原則，相同的事情要做相同的處理，不同的事情才做不同的處理，這就是平等。太極門案明顯沒有受到平等的對待，從民國55年成立迄今本質沒有變，卻只有一年要被課稅。因為一個檢察官的濫權，案件到現在沒有辦法解決，顯然是制度出了問題。

前臺灣基隆地方法院庭長陳志祥律師認為，太極門案刑事跟稅務案件，其實都是侵害信仰自由的案件，(民國)81年度的綜所稅案件依行政程序法第117條就可以直接撤銷，撤銷之後，原則上會認為之後的所有程序就失所附麗，都失效了，整個連根拔起解決。有關再審，刑事訴訟法再審幾乎都沒有時間限制，可是行政訴訟跟民事訴訟就有，5年而已。所以，如果認為81年度的判決是錯誤的，5年後就沒有辦法提再審。國家的錯誤不應該有時效限制，民事、刑事跟行政都一樣。